Nach dem Bau der Heilig-Geist-Kirche von 1898- 1902 stellte Firma G. F. Steinmeyer (Oettingen) im Jahr 1909 die erste große Orgel auf.
Am 16. April 1967 wurde diese durch die zweite Steinmeyer-Orgel mit 45 Register auf 3 Manualen und Pedal ersetzt. Eine Chororgel mit 17 Registern auf 2 Manualen und Pedal der gleichen Firma, die in der Apsis ihren Platz fand, wurde nur ein Jahr später am 1. August 1968 ihrer Bestimmung übergeben.
Nach umfangreichen Renovierungsarbeiten in der Kirche entschloss man sich 2010, die Chororgel in die vorherige Marienkapelle an der Westseite zu verlegen. Von der Vorgänger-Orgel blieben nur ein paar Register übrig.
Gehäuse, Technik, Klang und Spieltisch wurden von der Orgelbaufirma Thomas Eichfelder aus Bamberg neu konzipiert und am 14. November 2020 öffentlich vorgestellt.
Die offizielle Weihe der Instrumente fand im festlichen Gottesdienst zum Patrozinium am Pfingstsonntag, 12. Juni 2011 durch Weihbischof Helmut Bauer statt. Aufgeführt wurde die „Großen Orgelsolomesse“ in Es-Dur von Joseph Haydn.